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Colección de bacterias de origen marino (agua, bivalvos y peces) de la zona costera de la Comunidad Valenciana.
Colección de bacterias pertenecientes a los géneros Arcobacter y Aeromonas aisladas de muestras clínicas, agua, peces y otros alimentos.
Colección de bacterias patógenas aisladas de aguas y alimentos.
Colección de bacterias pertenecientes al género Legionella de origen ambiental.
Colección de levaduras aisladas de ambiente enológico. También de otras industrias alimentarias, flores, animales, aguas… de la región de Castilla-La Mancha.
Colección de microalgas aisladas de ecosistemas marinos, estuarino y de agua dulce.
La colección MAESE (Microalgas Edáficas del Sureste de España) contiene linajes aislados fundamentalmente del sureste de la península ibérica, de ambientes edáficos, subaéreos y acuáticos.
Colección de microalgas nocivas marinas aisladas de aguas españolas y resto de océanos, tanto aguas templadas como tropicales.
Colección formada por bacteriófagos,aislados de muestras ambientales, que infectan a cepas de Staphylococcus.
La colección ASUV de la Universitat de València es un recurso científico de microalgas simbióticas – ficobiontes de líquenes. Esta colección, única en España y una de las pocas a nivel mundial formadas exclusivamente por microalgas simbióticas de líquenes, destaca por las microalgas aisladas a partir de líquenes recolectados en territorios mediterráneos y macaronésicos. En la actualidad, ASUV consta de unas 75 cepas, que incluyen a 65 especies de 14 géneros. Entre los que se encuentran las principales microalgas liquénicas: Trebouxia, Myrmecia, Vulcanochloris y Asterochloris. Estas cepas son mantenidas mediante crioconservación a -20 ºC y -80 ºC y mediante el método tradicional de subcultivo.