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Colección de hongos endófitos aislados de plantas silvestres.
Colección de bacterias pertenecientes a los géneros Arcobacter y Aeromonas aisladas de muestras clínicas, agua, peces y otros alimentos.
Colección de bacterias fitopatógenas aisladas de plantas.
Colección de bacterias rizosféricas, fundamentalmente de los géneros Rhizobium, Sinorhizobium, Mesorhizobium y Bradyrhizobium.
Colección de hongos filamentosos, levaduras y bacterias aisladas de instalaciones, transporte y productos frescos hortofrutícolas.
Colección de levaduras no convencionales aisladas de alimentos y otros ambientes.
Colección de bacterias asociadas a distintas leguminosas, procedentes de tejidos vegetales y de la rizosfera. La colección tiene especial énfasis en el phylum Actinobacteria.
Colección de levaduras aisladas de ambiente enológico. También de otras industrias alimentarias, flores, animales, aguas… de la región de Castilla-La Mancha.
Colección de levaduras aisladas de ambientes fermentativos y ambientes naturales del grupo de investigación Biología de sistemas en levaduras de interés biotecnológico del Instituto de Agroquímica y Tecnología de los Alimentos (CSIC).
Colección de hongos fitopatógenos aislados de material vegetal.