Colección de levaduras aisladas de ecosistemas vínicos y oleícolas.
Colección de bacterias y levaduras aisladas de ambiente enológico.
Colección de hongos filamentosos, levaduras y bacterias aisladas de instalaciones, transporte y productos frescos hortofrutícolas.
Colección de hongos filamentosos y levaduras aislados principalmente de suelo y en menor proporción de material vegetal en descomposición y muestras clínicas.
Colección de bacterias, levaduras y hongos filamentosos aislados de productos cárnicos y productos lácteos.
Colección de bacterias asociadas a distintas leguminosas, procedentes de tejidos vegetales y de la rizosfera. La colección tiene especial énfasis en el phylum Actinobacteria.
Colección de levaduras aisladas de ambiente enológico. También de otras industrias alimentarias, flores, animales, aguas… de la región de Castilla-La Mancha.
Colección de microalgas aisladas de ecosistemas marinos, estuarino y de agua dulce.
La colección MAESE (Microalgas Edáficas del Sureste de España) contiene linajes aislados fundamentalmente del sureste de la península ibérica, de ambientes edáficos, subaéreos y acuáticos.
La colección ASUV de la Universitat de València es un recurso científico de microalgas simbióticas – ficobiontes de líquenes. Esta colección, única en España y una de las pocas a nivel mundial formadas exclusivamente por microalgas simbióticas de líquenes, destaca por las microalgas aisladas a partir de líquenes recolectados en territorios mediterráneos y macaronésicos. En la actualidad, ASUV consta de unas 75 cepas, que incluyen a 65 especies de 14 géneros. Entre los que se encuentran las principales microalgas liquénicas: Trebouxia, Myrmecia, Vulcanochloris y Asterochloris. Estas cepas son mantenidas mediante crioconservación a -20 ºC y -80 ºC y mediante el método tradicional de subcultivo.